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【前史】
　第一次世界大戦後、佐世保にも海軍航空隊が設置されることになり、崎辺地区の民有地173,286m²が買収された。４つの島を切り崩して海面を埋め立て１９２０年に佐世保海軍航空隊が開隊した。さらに陸上小型機が離着陸できる東西３００ｍの滑走路を持つ平地を埋立によってつくり、３９年に現在の地形ができあがった。
　戦後は連合国軍が接収し、４５年９月からは米軍によって通信施設、倉庫、野積場、ゴルフ場として使用された。
　太田貯油所は戦時中の４３年７月に旧海軍の給油施設として建設された。戦後は米軍が管理していたが、５４年に返還され海上自衛隊の貯油所として使用が始まった。また５９年３月に港湾防備を主任務とする佐世保防備隊が開隊し、米軍との崎辺地区の共同使用が開始した。
　崎辺突端一帯は佐世保港における唯一の広大な平坦臨港地区であり、その後、ＳＳＫ（佐世保重工業）の１００万トンドック建設用地獲得のため、市民挙げての返還運動が起こり ７４年に返還された。防備隊は76年にＳＳＫの１００万トンドック計画に伴って米軍ゴルフ用地に新設移転。８５年に崎辺地区の東側（129,397m²）は米軍に再提供された。

佐世保教育隊の施設

　１９６１年７月に崎辺地区の213,000m²が返還され、海上自衛隊へ払い下げられた。６５年４月に佐世保教育隊が発足し、隊舎、講堂、屋内訓練場、屋内プール（６９年）、自動車教習場（７６年）、体育館（８１年）などが整備されている。

佐世保警備隊本部

　また８７年７月に佐世保防備隊は佐世保警備隊に編成替えとなり、本部のほか陸警隊、港務隊、水中処分隊が置かれている。
９９年、大型護衛艦の佐世保配備に伴って太田貯油所に艦船燃料貯蔵用として新たに１基（約8,000キロリットル）の燃料タンクを建設している。現在は地下タンク２基、屋外タンク４基で、計約３万５０００キロリットルの貯油能力をもつ。０４年１１月にこれらの燃料管理などを行なう新管理棟が完成した。

太田貯油所の４基の屋外タンク

佐世保磁気測定所

　１９６４年１２月に佐世保造修所火工整備場が竣工。７６年には佐世保磁気測定所が完成し、７７年３月に魚雷・機雷・爆雷などの水雷武器の調整などを行う佐世保水雷整備所が新編となった。さらに９０年１０月にはＳＡＴＴ（対潜水艦戦術訓練施設：３階建て3,300m²）が完成した。この施設はシミュレーションを用いて、艦載哨戒ヘリを含む水上部隊の対潜戦術に関する訓練の維持向上及び乗組員の技術向上を図るもの。それまでは横須賀に１施設しかなかったが、護衛艦の増加で横須賀での限界を超えたために西の拠点である佐世保への建設となった。
　９１年３月末には佐世保誘導弾整備所も新編となった。これは「イージス艦こんごう」の佐世保配備計画に伴い、使用するミサイル弾の品質管理のための定期的な電子機器の機能点検、必要に応じた部品交換を行う施設である（第一整備場約1,200m²、第二整備場1,250m²）。９８年度の編成替えで水雷整備場と誘導弾整備場は佐世保弾薬整備補給所に改編された。
　一方、９２年１２月には127,000品目を収納できるという、海上自衛隊初の本格的自動倉庫である崎辺１号倉庫（3,438m²）が完成。９６年１０月には２号倉庫も運用を開始した。

高速ミサイル艇しらたか

　０３年３月に高速ミサイル艇「おおたか」「くまたか」が佐世保警備隊に配備され、佐世保警備隊に第３ミサイル艇隊が創設された。北海道・余市、京都・舞鶴に次ぐもの。０４年３月には「しらたか」も配備され、３隻体制となった。これは９９年の能登沖「不審船事件」を契機に設計変更となった、「はやぶさ」型ミサイル艇で、各部にレーダーに映りにくい構造をもち、最新の護衛艦に装備されている対艦ミサイル４発と７６ミリ速射砲という強力な攻撃能力を備えている。
ミサイル艇の駐艇場として浮桟橋（長さ約８０メートル、幅１２メートル、厚さ３・５メートルの鉄筋コンクリート製）が総工費は約４億円で建設された。

諸施設のひしめく崎辺地区突端。中央の細長い施設が米軍との共同利用の崎辺小銃射撃場。

　佐世保教育隊敷地内にある崎辺小銃射撃場は、もともと佐世保警備隊の保有していた黒髪射撃場の代替として８０年４月に竣工した。覆土式で長さ約１５０ｍ、小火器の射撃訓練として年間１４０日使用している。この施設は８３年９月より地位協定第二条４項(b)の施設として米軍が共同利用している（FAC5117）。使用は、原則として年間４回（各四半期１回）とし、使用期間は１回につき１日～３日とすることが協定書で取り決められている。しかし使用状況報告書を見る限り、それをはるかに上回る頻度で使用されていることがわかる。

◆崎辺小銃射撃場の限定使用に関する現地協定（日本語・英語）
◆米軍の使用状況報告書（1996～2000）